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基因測序技術(shù)是一種基因檢測技術(shù)，也被稱為DNA測序技術(shù)，是進行分子生物學(xué)研究和基因改造的基礎(chǔ)，也是解鎖人類生命奧秘的重要方式之一?；驕y序技術(shù)發(fā)展了40余年，已在眾多領(lǐng)域被廣泛應(yīng)用，包括生物的基因組圖譜繪制、物種進化演替過程、表觀遺傳學(xué)、疾病相關(guān)基因的確定和診斷等等。近年來，基因測序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)由實驗室研究演變到臨床使用，為我們理解人類生物學(xué)特征和疾病，評估遺傳疾病提供了關(guān)鍵性信息，所以說基因測序技術(shù)是下一個改變世界的技術(shù)毫不為過。
在疫情期間，這項技術(shù)得到了更多人的關(guān)注。疫情爆發(fā)初期，在不到一個月的時間內(nèi)，通過基因測序技術(shù)，病毒的基因組序列被公布，為分析病毒的進化來源、致病機制提供了一手資料。不少國家也發(fā)起了患者基因測序計劃，以了解個人基因?qū)Σ《靖腥痉磻?yīng)的影響，這項研究的數(shù)據(jù)將為患者護理及藥物處方提供信息，未來還可以幫助疫苗設(shè)計，從而拯救更多生命。
整個測序環(huán)節(jié)中，從樣品收集到上機測序，水貫穿了包括測序儀的日常清洗維護和試劑配制在內(nèi)的每一個環(huán)節(jié)。作為一個*的基礎(chǔ)試劑，水的品質(zhì)對終測序結(jié)果會產(chǎn)生顯著影響。水中的雜質(zhì)，如無機鹽、有機物、核酸酶、顆粒物等，不僅會污染設(shè)備，縮短測序儀毛細管的使用壽命，而且還會降低DNA聚合酶的活性，終干擾測序結(jié)果的準(zhǔn)確性。
下面這些基因測序經(jīng)常遇到的問題很有可能是使用的水有問題，快來看看你有沒有中招…
Q1：DNA測序樣品用什么溶劑溶解比較好？
溶解DNA測序樣品，使用超純水溶解較好。
原因： DNA的測序反應(yīng)的原理其實就是Taq酶的聚合反應(yīng)，需要一個適合的酶反應(yīng)條件。如果溶解DNA樣品的溶液含有過多的鹽，會影響測序反應(yīng)體系，造成Taq酶的聚合性能下降，干擾測序反應(yīng)甚至無法產(chǎn)生信號。
純水應(yīng)用Tips: 超純水機采用基因測序超純化柱，RephiLe 配方填料的低鎂型純化柱，可以特異性去除水中的鎂離子，降低空白本底對測序反應(yīng)體系的影響。
Q2：測序結(jié)果怎么沒有峰圖呢？
原因：模板被降解，罪魁禍?zhǔn)卓赡苁菧y序使用的水中含有核酸酶。
純水應(yīng)用Tips: 制備超純水的超純水機需要帶有終端濾器，如樂楓生物的RephiBio終端濾器，可以去除DNA酶和RNA酶。
Q3：為什么測序峰圖出現(xiàn)了“瀑布效應(yīng)”？
“瀑布效應(yīng)”是基線突然從高處下降的現(xiàn)象。
原因：樣品被有機物污染，有機物會被激發(fā)產(chǎn)生熒光，抬高基線。
純水應(yīng)用Tips: 使用帶有TOC檢測系統(tǒng)的超純水機,如樂楓Genie系列智能超純水系統(tǒng)，有機物含量低于5 ppb，采用全氧化法設(shè)計的TOC在線監(jiān)測系統(tǒng)，在線監(jiān)測TOC含量，符合ISPE制藥工程指南 / 美國藥典USP等標(biāo)準(zhǔn)對于TOC檢測的要求。
Q4：“釘子峰”如何避免？
“釘子峰”是A、T、C、G四個顏色的峰都被突然拔起，形成的尖銳峰形。
原因： 溶液中可能存在氣泡或者顆粒，氣泡和顆粒對激光全反射，形成“釘子峰”。
純水應(yīng)用Tips: 純水機取水口配備0.22μm的終端濾器，測序之前使用超聲波對超純水進行脫氣可以有效地防止“釘子峰”。
樂楓生物Genie系列智能純水系統(tǒng)以穩(wěn)定的水質(zhì)、智能的操作系統(tǒng)充分滿足基因測序用水需求，在諸多應(yīng)用到測序儀的實驗室常常會看到樂楓生物Genie系列智能超純水系統(tǒng)的身影。華大基因海外“火眼實驗室”采用的超純水機是Genie 系列的超純水系統(tǒng)。
關(guān)于樂楓生物
樂楓生物(Rephile Bioscience，Ltd.) 是一家專業(yè)從事水純化和實驗室分離純化產(chǎn)品研發(fā)、設(shè)計和制造的企業(yè)，為高科技生物技術(shù)和生命科學(xué)領(lǐng)域的用戶服務(wù)。樂楓公司著眼于發(fā)展，在中國、美國、法國、印度、南非等近20個國家建立了銷售機構(gòu)，同時也為大型公司提供OEM和ODM，產(chǎn)品銷往包括歐美的近100個國家。成立十余年，樂楓持續(xù)投入研發(fā)，創(chuàng)立出了自己的產(chǎn)品品牌RephiLe（瑞楓），推出了多個新概念產(chǎn)品- 無線連接的Genie系列純水系統(tǒng)和智能型大流量純水工作站Super-Genie等。目前樂楓純化柱填料配方齊全，也提供多款密理博純水系統(tǒng)的兼容耗材。
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關(guān)注RephiLe 公眾號：樂楓純水，關(guān)注樂楓動態(tài)！
